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古DNA论文
来自中世纪德国犹太人的全基因组数据表明德系犹太人创始人事件早于 14 世纪
Genome-wide data from medieval German Jews show that the Ashkenazi founder event pre-dated the 14th century
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来自中世纪德国犹太人的全基因组数据表明德系犹太人创始人事件早于 14 世纪
Genome-wide data from medieval German Jews show that the Ashkenazi founder event pre-dated the 14th century
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古DNA论文
哈萨克线粒体基因组为了解欧亚大陆中部的人类历史提供了线索
Kazak mitochondrial genomes provide insights into the human population history of Central Eurasia
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哈萨克线粒体基因组为了解欧亚大陆中部的人类历史提供了线索
Kazak mitochondrial genomes provide insights into the human population history of Central Eurasia
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古DNA论文
来自中世纪集体墓葬的基因组显示，与德系犹太人相关的遗传性疾病早于 12 世纪
Genomes from a medieval mass burial show Ashkenazi-associated hereditary diseases pre-date the 12th century
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古DNA论文
来自中世纪集体墓葬的基因组显示，与德系犹太人相关的遗传性疾病早于 12 世纪
Genomes from a medieval mass burial show Ashkenazi-associated hereditary diseases pre-date the 12th century
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古DNA论文
免疫基因的进化与黑死病有关
Evolution of immune genes is associated with the Black Death
传染病是驱动人类进化的最强选择压力之一 1,2 。这其中包括有记载历史上死亡人数最多的一次事件——第二次鼠疫大流行的首次爆发，俗称黑死病，由鼠疫耶尔森菌引起 3 。这场大流行重创了亚非欧大陆，导致高达30-50%的人口死亡 4 。为了识别可能在黑死病期间受到选择的基因位点，我们对来自两个不同欧洲人群的206份古代DNA提取物中免疫相关基因周围的遗传变异进行了表征，这些人群分别来自黑死病爆发前、爆发期间和爆发后。与一组非免疫基因位点相比，免疫基因位点显著富集了高度分化的位点，这表明存在正向选择。我们在伦敦数据集中识别出201个高度分化的变异。结合黑死病期间的证据、我们在丹麦的重复人群以及功能证据，位于ERAP2附近的rs2549794成为正向选择的最强候选位点。 rs2549794位点的选定等位基因与全长（而非截短型）ERAP2转录本的产生、对鼠疫耶尔森菌的细胞因子反应的变异以及巨噬细胞内鼠疫耶尔森菌控制能力的增强相关。最后，我们发现保护性变异与目前与自身免疫性疾病易感性增加相关的等位基因存在重叠，这为既往流行病在塑造当今疾病易感性方面所起的作用提供了经验证据。
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古DNA论文
免疫基因的进化与黑死病有关
Evolution of immune genes is associated with the Black Death
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传染病是驱动人类进化的最强选择压力之一 1,2 。这其中包括有记载历史上死亡人数最多的一次事件——第二次鼠疫大流行的首次爆发，俗称黑死病，由鼠疫耶尔森菌引起 3 。这场大流行重创了亚非欧大陆，导致高达30-50%的人口死亡 4 。为了识别可能在黑死病期间受到选择的基因位点，我们对来自两个不同欧洲人群的206份古代DNA提取物中免疫相关基因周围的遗传变异进行了表征，这些人群分别来自黑死病爆发前、爆发期间和爆发后。与一组非免疫基因位点相比，免疫基因位点显著富集了高度分化的位点，这表明存在正向选择。我们在伦敦数据集中识别出201个高度分化的变异。结合黑死病期间的证据、我们在丹麦的重复人群以及功能证据，位于ERAP2附近的rs2549794成为正向选择的最强候选位点。 rs2549794位点的选定等位基因与全长（而非截短型）ERAP2转录本的产生、对鼠疫耶尔森菌的细胞因子反应的变异以及巨噬细胞内鼠疫耶尔森菌控制能力的增强相关。最后，我们发现保护性变异与目前与自身免疫性疾病易感性增加相关的等位基因存在重叠，这为既往流行病在塑造当今疾病易感性方面所起的作用提供了经验证据。
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古DNA论文
欧亚腹地的古代成分和近期扩张：对中亚 Y 染色体系统发育的见解
Ancient Components and Recent Expansion in the Eurasian Heartland: Insights into the Revised Phylogeny of Y-Chromosomes from Central Asia
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欧亚腹地的古代成分和近期扩张：对中亚 Y 染色体系统发育的见解
Ancient Components and Recent Expansion in the Eurasian Heartland: Insights into the Revised Phylogeny of Y-Chromosomes from Central Asia
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古DNA论文
那曲地区高海拔藏族高地人群历史和生物适应的基因组洞察
Genomic insight into the population history and biological adaptations of high-altitude Tibetan highlanders in Nagqu
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古DNA论文
那曲地区高海拔藏族高地人群历史和生物适应的基因组洞察
Genomic insight into the population history and biological adaptations of high-altitude Tibetan highlanders in Nagqu
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古DNA论文
对马来西亚土著社区的序列分析揭示了 Hoabinhian 狩猎采集者和新石器时代农民之间的历史混合
Sequence analyses of Malaysian Indigenous communities reveal historical admixture between Hoabinhian hunter-gatherers and Neolithic farmers
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对马来西亚土著社区的序列分析揭示了 Hoabinhian 狩猎采集者和新石器时代农民之间的历史混合
Sequence analyses of Malaysian Indigenous communities reveal historical admixture between Hoabinhian hunter-gatherers and Neolithic farmers
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古DNA论文
匈奴人、阿瓦尔人和征服者的基因起源
The genetic origin of Huns, Avars, and conquering Hungarians
匈奴、阿瓦尔人和征服时期的匈牙利人是迁徙时期的游牧部落联盟，他们在公元5至9世纪分三批抵达喀尔巴阡盆地。根据历史资料，这些群体被认为都来自亚洲，但他们的确切起源以及与其他古代和现代人群的关系一直存在争议。近期，我们分析了来自中亚、蒙古和中国的数百个古代基因组，旨在从中识别上述群体的可能来源人群。在本研究中，我们对9个匈奴样本、143个阿瓦尔样本和113个匈牙利征服时期样本进行了测序，并识别出三个核心人群，分别代表了各个时期没有近期欧洲血统的移民。我们的研究结果表明，匈奴和阿瓦尔人的这个“移民核心”很可能起源于今天的蒙古，并且正如一些历史学家所提出的，他们的起源可以追溯到匈奴（亚洲匈人）。另一方面，征服匈牙利人的“移民核心”源自早期曼西人、早期萨尔马提亚人和晚期匈奴人后裔的混血。我们还发现，在青铜时代，梅若夫斯卡亚人和恩加纳桑人的混血催生了一个共同的“原始乌戈尔语”基因库，这与遗传和语言学数据相符。此外，我们在众多阿瓦尔人和匈牙利征服时期的遗传异常个体中检测到了与匈奴相关的共同祖先，表明这些先后出现的游牧群体之间存在遗传联系。除了移民核心群体外，我们还发现，每个时期的大多数个体都是拥有“欧洲本土”血统的当地居民。
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匈奴人、阿瓦尔人和征服者的基因起源
The genetic origin of Huns, Avars, and conquering Hungarians
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匈奴、阿瓦尔人和征服时期的匈牙利人是迁徙时期的游牧部落联盟，他们在公元5至9世纪分三批抵达喀尔巴阡盆地。根据历史资料，这些群体被认为都来自亚洲，但他们的确切起源以及与其他古代和现代人群的关系一直存在争议。近期，我们分析了来自中亚、蒙古和中国的数百个古代基因组，旨在从中识别上述群体的可能来源人群。在本研究中，我们对9个匈奴样本、143个阿瓦尔样本和113个匈牙利征服时期样本进行了测序，并识别出三个核心人群，分别代表了各个时期没有近期欧洲血统的移民。我们的研究结果表明，匈奴和阿瓦尔人的这个“移民核心”很可能起源于今天的蒙古，并且正如一些历史学家所提出的，他们的起源可以追溯到匈奴（亚洲匈人）。另一方面，征服匈牙利人的“移民核心”源自早期曼西人、早期萨尔马提亚人和晚期匈奴人后裔的混血。我们还发现，在青铜时代，梅若夫斯卡亚人和恩加纳桑人的混血催生了一个共同的“原始乌戈尔语”基因库，这与遗传和语言学数据相符。此外，我们在众多阿瓦尔人和匈牙利征服时期的遗传异常个体中检测到了与匈奴相关的共同祖先，表明这些先后出现的游牧群体之间存在遗传联系。除了移民核心群体外，我们还发现，每个时期的大多数个体都是拥有“欧洲本土”血统的当地居民。