古DNA研究前沿

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铁器时代英国的大陆移民涌入和母系居住现象

Continental influx and pervasive matrilocality in Iron Age Britain

Lara M. Cassidy · Nature

我们在这里分析了来自杜罗特里格墓葬遗址的 57 个古代基因组，发现了一个以单一母系为中心的扩大亲属群体，无关的（可能是向内迁移的）墓葬主要以男性为主。

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尽管存在共同的阿瓦尔时期文化，古代 DNA 仍揭示出生殖障碍

Ancient DNA reveals reproductive barrier despite shared Avar-period culture

Ke Wang · Nature

722 个个体的古代基因组数据以及维也纳南部（奥地利）邻近大型公元七至八世纪墓地的细粒度跨学科分析

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以弗所八角建筑中的颅骨

The cranium from the Octagon in Ephesos

Gerhard W. Weber · Scientific Reports

1929年，考古人员在土耳其以弗所的八角建筑石棺中发现一具保存良好的骨骼。此后近一个世纪，学界不断推测这位显然身份重要的人物是谁，其中反复出现的观点是：遗骸可能属于托勒密十二世之女、克利奥帕特拉七世的妹妹或同父异母妹妹阿尔西诺伊四世。 为回答这些问题，我们对颅骨开展先进的形态学、遗传学与年代分析，并进一步分析同墓出土骨骼的股骨及肋骨样本。颅骨与股骨的遗传分析证实，它们来自同一个体。颅骨的碳十四测年结果最可能落在公元前205至36年。由于确认该个体为男性，其与阿尔西诺伊四世的身份联系可以排除。 这具颅骨属于一名11至14岁的男孩，具有显著的发育异常。遗传数据提示其祖源来自意大利半岛或撒丁岛。据记载于公元前41年在以弗所被杀的阿尔西诺伊四世，其遗体下落仍然不明；但对于八角建筑中这名男孩的遭遇及社会背景，研究如今可以摆脱此前的身份猜测，继续推进。

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巴黎盆地（法国）新石器时代早期和中期人类的古遗传学研究

Paleogenetic study of Early and Middle Neolithic humans from the Paris Basin (France)

在这里，我们提供了来自巴黎盆地（法国）人类样本的古基因组数据。这些个体可以追溯到早期（公元前 5100 年 - 公元前 4800 年）和中新石器时代（公元前 4800 年 - 公元前 4000 年）。它们被发现于 7 个不同的考古遗址：Balloy-les-Réaudins、Gron-les-Sablons、Marolles-sur-Seine（lesCarrières-et les-Taupes）、Orville-les-Fiefs、Passy-la-Sablonnière、Vignely-la-Porte-aux-bergers。中新石器时代样本属于 Cerny 年代文化背景。

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揭秘粟特人的起源：古代中亚与东亚人基因混合的证据

Unraveling the Origins of the Sogdians: Evidence of Genetic Admixture between Ancient Central and East Asians

丝绸之路是一条连接中国与西方的古代贸易路线，促进了不同文明之间的商品、思想和文化习俗交流。粟特人是丝绸之路沿线的著名商人，以商人、工匠和艺人的角色而闻名。他们移居中国，形成了持久的社区，并繁衍了多代后代。尽管粟特人具有历史重要性，但关于其起源及其与当地人口互动的主要书面记录却非常有限。在这项研究中，我们为来自固原墓地唐代（公元 618-907 年）联合墓葬（M1401）的两个古代个体生成了全基因组数据。据我们所知，这是从粟特人群中获得的第一个古代基因组数据。我们的结果表明，女性个体表现出当地血统，而男性则携带当地血统和与中亚巴克特里亚-马尔吉亚纳考古群 (BMAC) 相关的其他遗传成分。这大约在 18 代前被引入当地基因库。结合历史、考古和遗传分析，我们得出结论，这两个人可能是夫妻。我们的研究结果表明，粟特人最初前往中国进行贸易，定居下来，与当地居民通婚，并在丝绸之路贸易中扮演了重要的中间人角色。这项研究强调了公元前一千年末粟特人在促进希腊化世界与秦汉王朝之间的联系方面的重要性，强调了早期粟特人的身份特征，这些特征先于他们后来成为丝绸之路的主要商人。

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波哥大高原长达 6000 年的基因组横断面揭示了哥伦比亚人口历史中的多次基因转变

A 6,000-year-long genomic transect from the Bogotá Altiplano reveals multiple genetic shifts in the demographic history of Colombia

Kim-Louise Krettek · Science Advances

对美洲原住民的遗传学研究彻底改变了我们对美洲人口历史的理解。然而，迄今为止尚未通过古代基因组学研究过的地区是哥伦比亚，它是进入南美洲的入口。在这里，我们报告了 6,000 至 500 年前哥伦比亚波哥大高原 21 名个体的全基因组数据。我们发现，陶器时代之前的狩猎采集者代表了一种以前未知的、源自最初南美辐射的基底谱系。这些狩猎采集者与古代北美群体没有差异亲和力，也没有在遗传上对古代或现在的南美人群做出贡献。到 2,000 年前，当地血统被与埃雷拉陶器群有关的中美洲人群所取代，尽管发生了重大的文化变革，但仍然在穆伊斯卡时期幸存下来。这些古老的高原个体与来自地峡的奇布查语使用者表现出比与哥伦比亚土著人更高的亲和力，这表明在随后的分散事件中，奇布查语相关血统的血统被稀释了。

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最早的现代人类基因组限制了尼安德特人混合的时间

Earliest modern human genomes constrain timing of Neanderthal admixture

Arev P. Sümer · Nature

现代人类在 45,000 多年前抵达欧洲，与尼安德特人至少重叠了 5,000 年 1,2,3,4。这些早期现代人类的有限基因组数据显示，至少有两个基因上不同的群体居住在欧洲，以捷克的 Zlatý kůň3 和保加利亚的 Bacho Kiro2 为代表。在这里，我们通过分析来自德国拉尼斯 Ilsenhöhle 约 45,000 年历史的遗骸的一个高覆盖率基因组和五个低覆盖率基因组以及来自 Zlatý kůň 的另一个高覆盖率基因组来加深对早期现代人类的了解。我们发现远亲关系将拉尼斯和 Zlatý kůň 个体联系在一起，并且他们属于同一个小而孤立的群体，该群体代表了与非洲之外血统最深的已知分裂。拉尼斯基因组包含尼安德特人片段，这些片段源自与所有非洲以外人共同的一次混合事件，我们将其追溯到大约 45,000-49,000 年前。这意味着迄今为止测序的所有非洲以外人的祖先当时都生活在一个共同的人群中，并进一步表明来自非洲以外 50,000 多年前的现代人类遗骸代表了不同的非洲以外人群。

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拼合祖先：比利时蓬默勒新石器时代与高卢—罗马时期人骨遗骸的处理

Assembling ancestors: the manipulation of Neolithic and Gallo-Roman skeletal remains at Pommerœul, Belgium

Barbara Veselka · Antiquity

比利时蓬默勒的古代墓地在20世纪70年代被归为高卢—罗马时期，包含76座火葬墓和1座土葬墓。然而，后续放射性碳分析将这座土葬墓定年为新石器时代晚期，即校正后的公元前第四至第三千纪。 本研究的骨骼考古学分析表明，该土葬由多个个体的骨骼组成，随后被作为“一个人”埋葬。古DNA分析同样发现多名个体的证据，并揭示了另一项意外发现：颅骨属于新石器时代之后，在遗传上与比利时另一处高卢—罗马遗址的一对兄弟姐妹具有亲缘关系。 这座拼合墓葬可能最初建于新石器时代晚期，后来由高卢—罗马人加入颅骨；也可能完全是在高卢—罗马时期拼合而成。这一特殊墓葬记录了史前和罗马时期出人意料的丧葬实践。

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秘鲁北海岸莫切精英墓葬的家庭关系（~500 CE）：对塞尼奥拉·德·考及其亲属的分析

Family relations of Moche elite burials on the North Coast of Peru (~500 CE): Analyses of the Señora de Cao and relatives

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新石器时代早期以来黄河下游流域基因组动态, 中国山东省距今 5396-1345 年的 69 个个体

Genomic dynamics of the Lower Yellow River Valley since the Early Neolithic

Panxin Du · Current Biology

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中欧第一批农民的社会和遗传多样性

Social and genetic diversity in first farmers of central Europe

Pere Gelabert · Nature Human Behaviour

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亚美尼亚人口的人口历史和遗传变异

Demographic history and genetic variation of the Armenian population

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来自沙特个体的参考质量、完全注释的二倍体基因组

A reference quality, fully annotated diploid genome from a Saudi individual

我们使用了多种测序方法对来自沙特阿拉伯的一名志愿者的基因组进行测序。我们使用所得数据生成基因组的从头组装，并使用不同的计算方法来完善组装。因此，我们提供了来自沙特阿拉伯的一名个体的所有染色体（除 Y 染色体外）的完整基因组的连续组装，并将此组装标记为 KSA001。我们将基因组注释从参考基因组转移以对 KSA001 进行完整注释，并使用 FAIR 数据原则将所有主要测序数据、组装和基因组注释免费提供给公共数据库。KSA001 是第一个来自沙特个体的端粒到端粒组装基因组，可免费用于任何目的。

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从古人类基因组推断唐代中国东部东西方混血现象

East and West admixture in eastern China of Tang Dynasty inferred from ancient human genomes

Rui Wang · Communications Biology

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皮塞纳文化的基因组图谱为意大利铁器时代和罗马帝国在意大利中部的遗产提供了新的见解

The genomic portrait of the Picene culture provides new insights into the Italic Iron Age and the legacy of the Roman Empire in Central Italy

Francesco Ravasini · Genome Biology

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从古人类基因组推断人口从中原向北部沿海扩张 - 山东淄博青蓝府古人

Population expansion from Central Plain to northern coastal China inferred from ancient human genomes

Baitong Wang · iScience

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唐朝首都的古代基因组揭示了丝绸之路东端跨欧亚交流的遗传遗产

Ancient genomes from the Tang Dynasty capital reveal the genetic legacy of trans-Eurasian communication at the eastern end of Silk Road

Minglei Lv · BMC Biology

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古代 DNA 挑战了对庞贝石膏模型的普遍解释

Ancient DNA challenges prevailing interpretations of the Pompeii plaster casts

Elena Pilli · Current Biology